Table 1 Binding interaction of emodin (EMO) with EGFR and MAP kinase proteins
| Compound- protein interaction | Docking scores (kcal/mol) | Hydrogen bond amino residues | Hydrogen bond length (Å) | Other bonding amino residues |
|---|---|---|---|---|
| EGFR-EMO | −8.6 | GLU C:400 GLU C:317 |
2.24 2.91 |
VAL C:336, ALA C:310 |
| MEK1-EMO | −7.3 | ALA A:769 GLU A:770 |
2.77 3.49 |
VAL A:776, VAL A:780, PRO A:773 |
| MEK2-EMO | −9.5 | GLN A:157 LEU A:78 ASN A:199 ASP A:212 GLY A:153 |
2.71 2.46 2.01 2.73 3.76 |
LEU A:201, ALA A:99, LEU A:78, HIS A:149, VAL A:86 |
| ERK1-EMO | −9.1 | GLN A:121 | 2.63 | ILE A:47, VAL A:55, LEU A:172, TYR A:52, LYS A:70 |
| ERK2-EMO | −8.3 | MET A:332 ARG A:69 |
2.72 2.17 |
GLU A:333, VAL A:172, ARG A:171 |
| p38-EMO | −8.6 | GLY A:109 HIS A:106 ALA A:110 ASP A:111 |
2.56 2.67 2.02 2.72 |
LEU A:166, VAL A:37, LYS A:52, LEU A:166, ALA A:50 |